土壤含盐量和酸碱度(pH值)对玉米生长发育有很大影响，可造成盐碱害。盐分中，氯离子对玉米为害最大。苗期较拔节、孕穗期耐盐力差，苗期表现为生长瘦弱，严重时接近枯萎。碱害主要影响玉米的幼根和幼芽，轻者使玉米空秆增多且易倒伏；重者缺苗断垄，同时导致钙、锰、锌、铁、硼等微量营养元素固定而引发缺素症。

玉米盐碱害的防治主要在于改良土壤。(1)种稻改良盐碱土 在良好的排灌条件下，低洼易涝盐碱地区，发展水稻是一项改良盐碱土的成功经验。(2)淤灌 引洪淤滔改良盐碱、沙荒，是我国北方劳动人民创造的一项成功经验。(3)平整土地 土地不平是形成盐碱的重要原因之一。(4）洗盐压盐灌溉改良措施 在有水利条件的地区，可用冲洗的方法改良盐碱地。(5)化学改良 盐碱地中有大面积的苏打盐渍化土壤和碱土，可结合本地区条件，因地制宜地使用石膏或糖厂的石灰沉淀渣、磷石膏、尿素、甲醛树酯、制碱工业的废料、氯化钙、黑矾、腐殖酸类肥料等加以改造。此外4增加土壤有机质等培肥措施与提高夏种指数、合理轮作等生物措施也可有效改良盐碱土。改良盐碱土是一项持久性的亟待解决的工作，各地应坚持不懈地开展下去。